Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1061545	1061642	98	29 [0]	[0] 78	torA	trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit

AAAACTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGAAAA  >  W3110S.gb/1061643‑1061703 |                                                             aaaaCTATCGCCGATATGATCTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTg        >  1:1261656/1‑55 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCa                            >  1:913769/1‑35 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:325140/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:541922/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:490631/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:474520/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:450279/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:398871/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:39620/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:389991/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:368284/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:327912/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:592460/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:324874/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:282049/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:26420/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:263359/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:247321/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:244512/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:243333/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:240187/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:747843/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:951500/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:94950/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:898742/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:896857/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:84814/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:838037/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:757461/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:74913/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:582823/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:716228/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:69494/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:658997/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:650581/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:650459/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:646118/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:600531/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:237187/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1158404/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1005908/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1320038/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:127941/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1266858/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1249020/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1229036/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1227289/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:121304/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1176848/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1334511/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:114943/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1142741/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1129101/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1099705/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1092388/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1089701/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1083089/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1008672/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:138768/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:214940/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:204926/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:177193/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1643540/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1638577/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1608260/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1602697/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1586945/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1563765/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1536617/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1532579/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1491456/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1468319/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1465958/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:1382698/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaa   >  1:348063/1‑60 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGaaa   >  1:1288407/1‑60 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATATGGTTTGAGaaaa  >  1:1301541/1‑61 (MQ=255) aaaaCTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATACGATGTGGTTTGAGaaaa  >  1:15465/1‑61 (MQ=255) |                                                             AAAACTATCGCCGATATGAACTACGACGATTGTCAGGGGCATCCGATGTGGTTTGAGAAAA  >  W3110S.gb/1061643‑1061703

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑