Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1064500	1064567	68	41 [0]	[0] 48	yccE	hypothetical protein

TTTTGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATG  >  W3110S.gb/1064568‑1064629 |                                                              ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:753938/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:397774/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:400879/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:41411/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:43343/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:443824/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:513335/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:568162/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:572282/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:636357/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:667160/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:7287/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:384428/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:766678/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:770274/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:777966/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:778303/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:778476/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:812260/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:869379/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:881112/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:891846/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:944011/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:954172/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1383743/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1024004/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1037509/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1142294/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1177380/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1183571/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1188802/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1231618/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1231638/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1261667/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1293044/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1359843/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:101000/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1384944/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1471856/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1478697/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1482653/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1511722/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1609740/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:210718/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:271531/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:341000/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATCCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:265079/62‑1 (MQ=255) ttttGAAAACACACTCGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATg  <  1:1583002/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATG  >  W3110S.gb/1064568‑1064629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑