Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1084378	1085063	686	138 [0]	[0] 41	ycdB	conserved hypothetical protein

GTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGT  >  W3110S.gb/1085064‑1085125 |                                                              gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:611306/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:229281/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:311919/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:312135/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:31784/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:406029/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:458853/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:462609/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:469094/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:544867/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:591254/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:175727/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:632481/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:770308/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:82935/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:933131/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:940985/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:941098/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:969489/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:982431/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:99773/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1336885/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1100575/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1123536/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1145593/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1175724/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1190052/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1203153/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:124709/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1258941/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1301065/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1046072/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1338143/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1352908/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1356848/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1365789/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1398518/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1519271/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1551212/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1583786/1‑62 (MQ=255) gTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGt  >  1:1612302/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTTTAATGTTTTTAGGCGGATAAGGCATTTGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTGCGCGT  >  W3110S.gb/1085064‑1085125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑