Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1094532	1095885–1095785	1254–1354	32 [0]	[0] 52	[ycdT]–insE	[ycdT],insF,insE

CTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAT  >  W3110S.gb/1095886‑1095946 |                                                             cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGTCACACGCGtt      >  1:688437/1‑57 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGcaca            >  1:1510806/1‑51 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:704160/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:351566/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:365011/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:485746/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:487703/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:518432/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:529681/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:559344/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:580576/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:591082/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:663255/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:699387/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1072523/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:710041/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:721917/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:753640/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:75909/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:781141/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:790/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:873488/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:8767/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:90555/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:918453/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:955393/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:277814/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1068127/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1193135/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1202/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1249050/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:125856/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1259609/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1270200/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1330186/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1384702/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1393298/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1404543/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:151976/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1546588/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1562028/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1571099/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1579963/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1611345/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:1624085/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:165826/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:206899/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:227305/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:260073/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:263035/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:318165/1‑61 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATGCCTGGCACACGCGTTTGAt  >  1:981683/1‑61 (MQ=255) |                                                             CTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAGTGCCTGGCACACGCGTTTGAT  >  W3110S.gb/1095886‑1095946

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑