Missing coverage evidence...
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CTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATC  >  W3110S.gb/1099275‑1099335 |                                                             cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGAt               >  1:358487/1‑48 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCa    >  1:1163138/1‑59 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCa    >  1:482981/1‑59 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCa    >  1:1417856/1‑59 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:66961/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:408538/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:420990/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:464452/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:488208/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:553786/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:554335/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:590048/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:595477/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:64911/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:649668/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:990968/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:678516/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:69403/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:753703/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:761445/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:766202/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:875260/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:9043/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:952585/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:968598/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1055026/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1523166/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1080907/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:111300/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1326268/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1330939/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1337100/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1351054/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1358066/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1373129/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:140775/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:370903/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1553334/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1569973/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1600805/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1641470/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:199959/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:201190/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:228657/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:289473/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:307801/1‑60 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATc  >  1:780269/1‑61 (MQ=255) cTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGAGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1510436/1‑60 (MQ=255) cTTCATGAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt   >  1:1607780/1‑60 (MQ=255) |                                                             CTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATC  >  W3110S.gb/1099275‑1099335

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑