Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1132033	1132896	864	105 [0]	[0] 24	[flgA]–[flgB]	[flgA],[flgB]

TATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGC  >  W3110S.gb/1132897‑1132951 |                                                       tatGGATCGCGTACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:663316/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCaa              >  1:1130334/1‑43 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCTATACCAGATGAGc  >  1:669374/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAg   >  1:411778/1‑54 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:624935/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:936975/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:917167/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:877249/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:853025/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:78734/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:770665/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:734617/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:721673/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:68175/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:1045010/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:618304/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:59848/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:595846/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:360923/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:260774/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:174605/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:1470318/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:1123737/1‑55 (MQ=255) tatGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGc  >  1:1115965/1‑55 (MQ=255) |                                                       TATGGATCGCGAACGCACCCAGTTTGCCGATAACAGCCTGCAATACCAGATGAGC  >  W3110S.gb/1132897‑1132951

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑