Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1137142	1137180	39	79 [0]	[0] 45	flgH	flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring

TGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCG  >  W3110S.gb/1137181‑1137242 |                                                              tgtttGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1592117/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCTCCTGGATACACTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:247351/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTc                        >  1:671202/1‑40 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGc   >  1:90146/1‑61 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGc   >  1:1634533/1‑61 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGc   >  1:1207883/1‑61 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGc   >  1:367797/1‑61 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGc   >  1:604784/1‑61 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:212505/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:167625/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:251709/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:264335/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:472975/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:533055/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:546940/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:548119/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:710512/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:734525/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:739472/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:77413/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:818174/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:91092/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:991928/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:995289/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1048222/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1074499/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1076502/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1150834/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1159450/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1166957/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1227952/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1271040/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1309860/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1355855/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1441353/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1463798/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1527705/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1536240/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:155373/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1607643/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1626074/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1636604/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:211597/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACACTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:1416465/1‑62 (MQ=255) tgttgGTGCTTTCAATAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCg  >  1:628396/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCG  >  W3110S.gb/1137181‑1137242

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑