Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1190683	1190929	247	160 [0]	[0] 93	phoQ	sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

GTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAT  >  W3110S.gb/1190930‑1190990 |                                                             gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTAt                     >  1:859115/1‑42 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCTCTTCAAt  >  1:1145530/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCaa   >  1:1064425/1‑60 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCaa   >  1:1516712/1‑60 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCaa   >  1:479758/1‑60 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCaa   >  1:1329989/1‑60 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCa    >  1:1378903/1‑59 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:575321/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:657225/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:537403/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:523928/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:51397/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:497791/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:493995/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:493260/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:477994/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:470460/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:454805/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:428644/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:427249/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:378771/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:353844/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:347682/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:344743/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:337095/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:309183/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:303122/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:294541/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:745995/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:999611/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:97298/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:962167/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:954826/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:9448/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:884614/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:851534/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:837212/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:815561/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:789338/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:59464/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:738350/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:704996/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:69212/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:691971/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:682004/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:675561/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:665282/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:263550/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:623408/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1309945/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:293562/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1465617/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1422195/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1413447/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1402643/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1402640/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:136633/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1363135/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1332704/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1330537/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1468710/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1292598/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1267996/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1265814/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1243799/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1243686/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1181403/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1171151/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1098776/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1064199/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:17310/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:277724/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1020722/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:247552/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:235514/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:231485/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:229513/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:226218/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:187409/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:186298/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1533089/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:166475/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1647168/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1634891/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1599962/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1596459/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1594980/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1571033/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1567143/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1564900/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1539177/1‑61 (MQ=255) gTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCAGCTTCAAt  >  1:986829/1‑61 (MQ=255) gTTGATGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAt  >  1:1221197/1‑61 (MQ=255) |                                                             GTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTATCGTTAACATCCGCTTCAAT  >  W3110S.gb/1190930‑1190990

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑