Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1243433	1244316	884	86 [0]	[0] 43	[cvrA]–[ldcA]	[cvrA],[ldcA]

CCGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCG  >  W3110S.gb/1244317‑1244378 |                                                              ccGCTCTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:830779/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGACTGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:35911/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:48593/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:191042/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:199541/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:204375/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:209792/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:24396/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:249256/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:267452/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:346254/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:352516/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1642098/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:495606/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:542/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:834369/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:884599/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:925106/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:966566/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:969320/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:982255/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:994377/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1276550/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1012803/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1135321/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1148610/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1157838/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1175904/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1210832/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1234373/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1245263/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1253288/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1267447/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1312459/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1332070/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:139528/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1410977/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1467946/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1468001/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1524925/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1532464/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCg  <  1:1536734/62‑1 (MQ=255) ccGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGGCATGTTGTTGGCg  <  1:1010764/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTCCGCAAATGAGCAACGGGTCATGTTGTTGGCG  >  W3110S.gb/1244317‑1244378

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑