Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1272385	1272895	511	123 [0]	[0] 87	chaA	calcium/sodium:proton antiporter

AATTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGAA  >  W3110S.gb/1272896‑1272957 |                                                              aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTTAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1345469/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:363486/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:553556/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:504453/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:47886/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:465986/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:465897/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:43545/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:429028/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:408047/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:403385/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:575109/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:351413/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:346537/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:30821/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:270764/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:264976/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:202049/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:2019/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:186926/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:181513/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:161728/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:732507/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:940419/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:937471/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:877587/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:854752/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:788968/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:777814/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:773487/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:759242/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:750604/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:738221/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1601541/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:718289/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:714232/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:678965/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:665399/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:646313/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:638542/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:607665/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:591052/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:591051/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:588218/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1140857/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1283650/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1269434/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1235588/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1221026/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:121345/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1199884/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1178844/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1163800/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1160190/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1157524/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1284905/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1126357/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1124564/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1120896/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1100647/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1086085/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1083565/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1074986/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1054814/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1043629/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1032970/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:142273/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1015713/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1597435/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:158800/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1575576/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1563740/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1527292/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1509566/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1469752/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1435554/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1429710/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1613228/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1416867/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1406720/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1403124/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1370675/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1369170/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1348710/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:134400/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1324284/62‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGaa  <  1:1303405/62‑1 (MQ=255) |                                                              AATTAATGCTACCAGTAACGCCTGACCGGTTGAAAAATTCGCCGCAGGCAGAGCCATTGGAA  >  W3110S.gb/1272896‑1272957

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑