Missing coverage evidence...
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GTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACAAA  >  W3110S.gb/1332377‑1332437 |                                                             gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:682477/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:391591/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:421556/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:445212/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:502428/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:5360/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:558591/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:608802/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:614765/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:646538/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:283430/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:698950/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:699399/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:722031/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:759728/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:78817/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:846034/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:909111/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:919715/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1354246/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1067691/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1109368/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1121394/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1136240/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1212655/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1287637/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1300851/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1309900/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1026907/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1365381/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1448772/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:146756/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:1620852/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:206668/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:253343/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaaa  >  1:254845/1‑61 (MQ=255) gTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACaa   >  1:1369692/1‑60 (MQ=255) |                                                             GTTCATTATTTACTCCTTAAACAAGGACATTAGTCTACGCCAGGCATGGCTTGCAGACAAA  >  W3110S.gb/1332377‑1332437

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑