Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1344013	1344527	515	41 [0]	[0] 58	[pyrF]–[yciH]	[pyrF],[yciH]

GTCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAATGCGGCT  >  W3110S.gb/1344528‑1344588 |                                                             gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:680876/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:409293/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:413990/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:443350/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:47298/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:482632/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:49655/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:546185/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:554290/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:604917/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:605317/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:624230/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:631747/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:639369/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:657413/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:316624/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:690439/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:698191/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:705686/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:706662/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:730532/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:732761/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:753495/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:787660/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:790464/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:807085/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:813732/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:849699/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:875121/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1532398/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1059731/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1064966/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1111337/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1124042/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1141247/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1151201/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:117053/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1185683/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1224328/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1354142/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1363805/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1364651/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:141377/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1491244/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1029797/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1547570/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1554996/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1587/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1642998/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:1651354/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:171033/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:174190/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:198984/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:218841/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:235213/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:28034/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:297384/61‑1 (MQ=255) gtCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAAtgcggct  <  1:30206/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTCGATCTCGATGATGCCGAACTGACAAAACTTGCAGCGGAACTGAAGAAAAAATGCGGCT  >  W3110S.gb/1344528‑1344588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑