Missing coverage evidence...
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CGCGTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAT  >  W3110S.gb/1349349‑1349410 |                                                              cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCttct  <  1:1502457/62‑3 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:439175/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1642166/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:176492/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:180234/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:195978/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:265107/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:266745/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:3497/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:380994/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:434205/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1640252/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:541228/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:612360/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:626683/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:64482/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:853008/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:89935/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:904207/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:910893/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:943398/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1304995/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:103241/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1060200/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1071167/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1134129/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1137388/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1145420/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1181947/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1183939/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1255166/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1266234/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1007386/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1340235/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1343494/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:134410/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1427822/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:147104/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1570011/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1605109/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:1631136/62‑1 (MQ=255) cgcgTCGGCATTCGCAGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAt  <  1:174215/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCGTCGGCATTCGCCGGATCAAAGCCCATATGCACGTTATAGATGCCAAAACCGAGCTTAT  >  W3110S.gb/1349349‑1349410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑