Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1413730 1414454 725 38 [0] [0] 36 intR integrase

GATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGT  >  W3110S.gb/1414455‑1414516
|                                                             
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:687471/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:361047/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:3663/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:377103/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:39918/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:462397/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:503662/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:597768/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:611045/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:329623/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:728060/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:769744/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:801911/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:836328/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:850057/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:852083/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:875924/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:914487/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1442190/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1176792/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1180904/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1185793/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1187257/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1208202/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1301591/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1440397/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1146466/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1453839/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1471303/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1488573/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:1600502/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:161394/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:163462/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:192036/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGt  <  1:211377/62‑1 (MQ=255)
gATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCCTGGATTATCCAGGt  <  1:142025/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
GATATAGTTATCAACTGTGCGCACGGTTCTTCCTTTTTTGTTGGATCTTGGATTATCCAGGT  >  W3110S.gb/1414455‑1414516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: