Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1427690	1428189	500	56 [0]	[0] 93	[ydaY]–[ynaA]	[ydaY],[ynaA]

TCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAT  >  W3110S.gb/1428190‑1428249 |                                                            tcGCACTAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:68231/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCTCTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1603921/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATTCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:702106/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATTCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:613477/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:500177/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:642543/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:64087/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:63592/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:608292/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:578687/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:57055/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:544864/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:532663/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:510226/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:693088/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:481539/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:393509/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:391459/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:374196/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:366986/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:35885/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:313884/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:275777/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:269976/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:264657/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:896787/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:991036/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:986414/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:984000/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:973978/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:963080/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:953344/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:947525/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:942126/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:921884/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:905614/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:248659/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:891933/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:888192/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:85237/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:839181/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:835853/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:752587/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:717152/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:713991/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:700463/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:697712/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1173906/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1333992/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1332498/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1311973/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1298606/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1245760/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1233826/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1229787/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1210923/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1209464/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1202453/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1195744/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1423592/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1164104/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1162698/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1145834/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1114253/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:10911/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1088603/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:108406/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1068343/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1055930/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1019498/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1590455/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:238889/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:22987/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:220978/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:213778/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:182074/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1617046/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1608062/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1604712/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1600013/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1012922/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1577784/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1548187/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1528976/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1487449/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1466574/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:146145/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1458017/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1454649/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1449300/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1443456/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCAGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:1645926/60‑1 (MQ=255) tcGCAATAATTATTGATAACACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAt  <  1:339418/60‑1 (MQ=255) |                                                            TCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCAT  >  W3110S.gb/1428190‑1428249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑