Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1429606	1430398	793	21 [0]	[0] 15	lomR insH	ECK1366:JW5884+JW5904:b4570; Rac prophage region; hypothetical protein IS5 transposase and trans‑activator

AGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGC  >  W3110S.gb/1430399‑1430460 |                                                              aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCatgat                   >  1:28419/1‑45 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1086030/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1264038/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1291715/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1537463/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:295487/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:340363/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:568606/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:921361/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:923366/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:923991/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:929904/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:997983/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGACGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1365578/1‑62 (MQ=255) aGTGCTGAATACACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATgcgc  >  1:1516012/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGTGCTGAATTCACTATCGGCGAAGGTGAGTTGATGGCTCATGATGTCCCTCTGGGATGCGC  >  W3110S.gb/1430399‑1430460

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑