Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1484495	1484580	86	106 [0]	[0] 69	[azoR]	[azoR]

TCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTG  >  W3110S.gb/1484581‑1484642 |                                                              tCCTTATAGATGTTTTAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:14306/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:627897/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:714517/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:708271/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:702844/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:700577/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:692215/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:660984/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:641968/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:759882/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:617267/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:593884/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:590194/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:565495/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:54820/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:526572/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:488555/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:477501/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:841106/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:993661/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:946303/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:941571/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:895584/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:863795/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:857162/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:848722/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:843037/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:720448/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:83212/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:826571/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:818076/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:786142/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:778606/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:772946/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:437386/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1439411/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1068556/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:108584/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1122129/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1163884/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1175950/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1192571/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1196362/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1221700/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1228012/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:123208/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1248605/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1252425/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1333884/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1363006/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1449239/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1543110/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:395475/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:367629/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:341161/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1630038/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1597256/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1593880/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1567406/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1460335/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1538085/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:153726/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1519031/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1507189/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1506285/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATCCACAATCCTg  <  1:1430998/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTGGGTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:459745/62‑1 (MQ=255) tCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCAGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1222568/62‑1 (MQ=255) tCCTAATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTg  <  1:1000897/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCCTTATAGATGTTTGAATGGGCGATGCCCCGTTGCTTGTTGACACTTTATTCACAATCCTG  >  W3110S.gb/1484581‑1484642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑