Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1537264	1537538	275	30 [0]	[0] 25	yddE	conserved hypothetical protein

TAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAT  >  W3110S.gb/1537539‑1537600 |                                                              tAAAAGCATCGACGTTGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:360444/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGTCTGGAGAACTAt  <  1:1037567/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTTGAGAACTAt  <  1:338560/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:357327/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:784641/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:76427/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:656506/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:579111/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:5367/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:452931/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:445686/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:407084/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1071656/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1021331/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:268325/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:249645/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:209329/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:173572/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1588988/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1494273/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1408370/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1090706/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATAAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:854076/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGGTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:1153713/62‑1 (MQ=255) tAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGAGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAt  <  1:775744/62‑1 (MQ=255) |                                                              TAAAAGCATCGACGTGGTACACCTGCGGTTTCATTAACGTTCTCCTGTGACTGGAGAACTAT  >  W3110S.gb/1537539‑1537600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑