Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1616396	1616433	38	27 [0]	[0] 59	[yneI]	[yneI]

TGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCA  >  W3110S.gb/1616434‑1616494 |                                                             tGAGTCATGGTATGATGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:803277/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAataata          >  1:19423/1‑53 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGc    >  1:619404/1‑59 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:746740/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:358566/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:380740/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:383275/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:443048/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:502315/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:553620/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:555954/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:560090/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:566069/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:572417/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:700514/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:734123/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:104724/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:785412/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:814623/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:814922/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:845622/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:881628/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:892745/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:905768/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:908116/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:909928/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:940485/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:959412/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:999633/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1375302/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:10644/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1131211/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1180176/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1193510/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1195341/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1234665/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1249282/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1295571/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1300501/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1301763/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:130548/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1305780/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1347245/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1414266/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1419815/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1462487/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1482966/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1540748/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1555440/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1041631/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1613803/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1617341/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1648339/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:227280/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:236928/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAACCCa  >  1:181240/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTAGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:289763/1‑61 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATATACTCTTGCTTTAAAATGaat              >  1:999767/1‑49 (MQ=255) tGAGTCATGGTATGAAGATAAGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCa  >  1:1593021/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCA  >  W3110S.gb/1616434‑1616494

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑