Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1684030	1684132	103	20 [0]	[0] 40	rstA	DNA‑bindng response regulator in two‑component regulatory system with RstB

CATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGTTT  >  W3110S.gb/1684133‑1684194 |                                                              caTCCTGGCACTGGAGATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:1731/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCATAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:449730/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAacg                  >  1:549482/1‑46 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGc              >  1:121634/1‑50 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:629871/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:236811/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1062282/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:281597/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:311486/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:488310/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:611077/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:247465/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:744418/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:755522/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:826062/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:8546/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:880046/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:894975/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:949974/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1505521/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1163492/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1199456/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:123213/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1332796/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1336962/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1360221/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1416719/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:212094/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1591406/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:17992/1‑62 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:1568893/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:701537/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:802868/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:33149/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:1598268/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:1643811/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtt   >  1:1176751/1‑61 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGtc   >  1:402807/1‑60 (MQ=255) caTCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGt    >  1:611040/1‑60 (MQ=255) caTCCGGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGttt  >  1:1589325/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATCCTGGCACTGGAAATGGGTGCCTGCGACTATATTCTCAAAACGACGCCCCCTGCTGTTT  >  W3110S.gb/1684133‑1684194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑