Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1974766	1974820	55	24 [0]	[0] 62	cheW	purine‑binding chemotaxis protein

ACCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAC  >  W3110S.gb/1974821‑1974882 |                                                              aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGcac                          >  1:602864/1‑38 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAAt                       >  1:1270879/1‑41 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGa   >  1:500171/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGa   >  1:681742/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGa   >  1:710538/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGa   >  1:505757/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGa   >  1:1266608/1‑61 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:470233/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:495746/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:756103/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:397058/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:579499/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:347149/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:6161/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:632113/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:662916/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:313200/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1024484/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:300062/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:767101/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:796962/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:80366/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:813499/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:826614/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:869128/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:875645/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:878346/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:930822/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:93135/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:95500/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:95551/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:264089/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1063347/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1075308/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:111446/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1263514/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1289286/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1298328/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1344121/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1424709/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1440675/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:146777/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1483739/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1488056/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1561992/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1633241/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:270806/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:248262/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:226323/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:213523/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:207720/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1571559/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1601361/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1590015/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1577984/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1573578/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACACCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1620082/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAAAGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:737878/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGACAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTTGTGAc  >  1:1554614/1‑62 (MQ=255) aCCTGGCTGAACTAAAATCGTAAGACAACAAACGGCACAATAACGCCGCGCAGAATCGt     >  1:412857/1‑59 (MQ=255) aCCTGGATGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:890422/1‑62 (MQ=255) aCCTGCCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAc  >  1:1103896/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACCTGGCTGAACTTAATTCGTAAGTCAACAATCGGCACAATAACGCCGCGCAGATTCGTGAC  >  W3110S.gb/1974821‑1974882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑