Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2021336	2021693	358	102 [0]	[0] 56	[fliK]	[fliK]

TGCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCG  >  W3110S.gb/2021694‑2021734 |                                         tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:650138/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:313697/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:349168/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:352143/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:378853/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:458275/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:484166/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:522468/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:539950/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:54935/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:578059/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:646273/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:648241/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:648762/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:206283/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:671543/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:702741/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:747423/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:757941/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:775739/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:80399/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:815161/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:834402/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:835231/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:864134/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:887288/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:942456/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:982886/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1427482/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1097296/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1106521/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1128094/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1140564/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1174732/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:133207/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1334585/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:133476/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1356455/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1363474/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1394713/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1397482/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1425526/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1054717/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1471157/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1477797/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1481206/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1490655/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1491953/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1495467/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:155265/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1559900/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1561846/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1589387/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1597956/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:1625792/41‑1 (MQ=255) tgCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCg  <  1:206276/41‑1 (MQ=255) |                                         TGCGCTCAAGACGCAGGATAATTAGCCGATAAGCAGTAGCG  >  W3110S.gb/2021694‑2021734

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑