Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2076670	2077622	953	8 [0]	[1] 38	[flu]–[yeeR]	[flu],[yeeR]

CATTTCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGTT  >  W3110S.gb/2077620‑2077682    |                                                            cATTTCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGA‑GGAAACTGGtt  <  1:384359/62‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:673991/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:274823/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:354687/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:37320/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:459436/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:651978/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:65564/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:664528/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:667392/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:217848/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:697417/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:753913/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:77485/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:810468/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:822679/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:863130/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:891381/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:932138/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:137131/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1073329/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1131929/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:120177/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1243706/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1264418/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1288776/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1329089/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1330805/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1331827/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1022816/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1387682/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1451224/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1458824/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1467832/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1547774/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1583358/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:1603784/60‑1 (MQ=255)    ttCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGtt  <  1:206714/60‑1 (MQ=255)    |                                                            CATTTCTCAACGGATTTCCCGGGGAGAGCTGAGGGAATTTGAACTGGCAGACGGAAACTGGTT  >  W3110S.gb/2077620‑2077682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑