Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2147044	2147113	70	52 [0]	[0] 95	yegE	predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

TTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGG  >  W3110S.gb/2147114‑2147152 |                                       ttGATATGGCGATTAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:426439/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAgggg  <  1:299999/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:401518/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:583535/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:578178/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:5694/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:508616/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:49644/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:479073/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:454336/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:452750/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:449439/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:422566/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:658865/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:390009/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:387908/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:386054/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:364783/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:339991/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:314826/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:302517/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:2969/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:28345/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:267570/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:850271/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:991576/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:986534/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:972861/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:925006/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:918764/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:904728/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:902132/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:866192/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:858704/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:855135/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:85178/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:243864/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:834521/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:782469/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:781260/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:740649/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:739602/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:738211/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:722108/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:697262/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:696228/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:667904/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:664981/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:125628/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:14168/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1395854/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1395608/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:133715/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1335666/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1321235/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:130496/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1301607/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1293105/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1281065/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1263549/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1436678/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1253394/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1199891/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1185361/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1151856/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1130911/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:110831/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1106693/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1077187/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1047298/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1025318/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1578846/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:242384/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:210150/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:198682/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:176679/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:173507/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:171397/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:166589/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1650090/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1630342/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1599461/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1015702/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1564692/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1561043/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1555228/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1546926/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1517586/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1512575/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1510828/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1466698/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1456695/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1452272/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1438567/39‑1 (MQ=255) ttGATATGGCGAGGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTgg  <  1:1136927/39‑1 (MQ=255) |                                       TTGATATGGCGATGAAAATTACCTTTATGAATCCAGTGG  >  W3110S.gb/2147114‑2147152

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑