Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2156228	2156942	715	72 [0]	[0] 86	mdtA	multidrug efflux system, subunit A

ATCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAT  >  W3110S.gb/2156943‑2157004 |                                                              aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAAc           >  1:98383/1‑53 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGa   >  1:927944/1‑61 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGa   >  1:1426906/1‑61 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGa   >  1:79895/1‑61 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:532353/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:304782/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:527019/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:51882/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:495946/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:487773/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:461093/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:4420/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:439439/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:423666/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:42206/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:370531/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:354616/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:352773/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:350947/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:348670/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:34006/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:316498/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:31610/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1043641/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:740798/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:981767/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:941200/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:897071/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:896308/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:879015/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:836424/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:813750/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:793420/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:792809/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:54594/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:706931/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:694817/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:691059/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:680632/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:679533/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:661799/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:629207/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:584889/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:549813/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1315668/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1448174/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1447917/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1423665/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1397291/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1397221/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:138871/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1383921/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1374917/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1329457/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1459028/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1315127/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1302411/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1237008/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1202321/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1171927/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1149437/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1123146/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1107884/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1005722/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:158668/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:239230/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:212552/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:200957/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:199245/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:198384/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:198331/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:190387/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1619982/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1588725/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1466078/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1522273/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1521310/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1517447/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1505510/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1503508/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1485226/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1483523/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1479777/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1478157/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACCCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:256124/1‑62 (MQ=255) aTCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGACACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAt  >  1:1068157/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCGCACCAACTCGAAGAAATTAAGTGAAGGCACGCTGTTAAGTCTAGATAACCAAATCGAT  >  W3110S.gb/2156943‑2157004

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑