Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2199504	2199684	181	107 [0]	[0] 82	[metG]	[metG]

GCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGATTTT  >  W3110S.gb/2199685‑2199738 |                                                      gCATCGACAGCTCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1417226/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCTTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:133390/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTGTTGCGAtttt  <  1:181807/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:506865/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:576150/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:489580/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:485887/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:485122/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:474203/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:463016/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:458109/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:453592/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:446872/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:427882/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:414967/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:409165/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:394969/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:364236/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:358656/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:351629/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:336997/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:333811/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:321483/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:691154/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:992929/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:95815/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:930757/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:922451/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:862006/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:830694/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:821719/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:775657/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:759620/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:526253/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:662724/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:656021/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:652883/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:639948/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:624965/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:61108/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:605345/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:596890/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:30244/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1293731/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1450635/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1432960/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1426110/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1423646/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1383407/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1373601/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1370847/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1363894/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1301935/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:145479/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1271758/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1259644/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1259512/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1250506/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:120147/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1192027/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1168/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1150150/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1093411/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:169002/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1080295/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:300916/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:245536/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:239554/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:215416/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:209321/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:194080/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:18850/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:187747/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:309406/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1640907/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1639459/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1638049/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1633678/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1597132/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1590579/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1578159/54‑1 (MQ=255) gCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGAtttt  <  1:1489778/54‑1 (MQ=255) |                                                      GCATCGACAGCGCCTTTTCTTTATAAATTCCTAAAGTTGTTTTCTTGCGATTTT  >  W3110S.gb/2199685‑2199738

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑