Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2201577	2201583	7	63 [0]	[0] 33	molR molR	DNA‑binding transcriptional regulator; ECK2108:JW2102+JW5915+JW5916:b4499 DNA‑binding transcriptional regulator, middle fragment; ECK2108:JW5915:b2116

TGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACC  >  W3110S.gb/2201584‑2201639 |                                                        tGGCTATATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:437320/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTGAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1296462/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCATCCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1536347/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:418361/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:159450/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1603137/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1633769/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:383288/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:388074/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:395525/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:414715/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1549894/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:425743/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:467071/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:482758/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:537021/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:679876/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:941813/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1593378/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1031449/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1516171/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1491260/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1403766/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1343304/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1300394/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1298324/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1271492/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:125788/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1225322/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1189618/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:108471/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1076694/56‑1 (MQ=255) tGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCAcc  <  1:1060223/56‑1 (MQ=255) |                                                        TGGCTAAATGAAGATTATTCAACCTTACTAAGTGAATTTAAGGTGTTTCATTCACC  >  W3110S.gb/2201584‑2201639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑