Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2235254	2235401	148	30 [0]	[0] 42	cdd	cytidine/deoxycytidine deaminase

AATTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCG  >  W3110S.gb/2235402‑2235462 |                                                             aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTg                         >  1:274417/1‑38 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGct  >  1:1581260/1‑60 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGc   >  1:316247/1‑60 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:637944/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:404312/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:414072/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:438656/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:485055/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:497905/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:500130/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:57287/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:6118/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:389274/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:655255/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:704889/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:720766/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:750382/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:839994/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:867149/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:911145/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:928128/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:933721/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:949686/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1551089/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1089271/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:110859/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1157109/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1255037/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1255941/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1268463/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1387101/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1453938/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1535426/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:393033/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1562219/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:176741/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:257264/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:272864/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:291139/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:319276/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:38389/1‑61 (MQ=255) aaTTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCg  >  1:1072682/1‑61 (MQ=255) |                                                             AATTGCGCGCGGTGTGAGCGGAACCTGGTATTTCGGTGCCAATATGGAATTTATTGGTGCG  >  W3110S.gb/2235402‑2235462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑