Missing coverage evidence...
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TTAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAA  >  W3110S.gb/2267540‑2267592 |                                                     ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTtagcccttg          >  1:907063/1‑45 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCGTTGCCCGTGaa  >  1:1465970/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:709572/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1630937/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:172305/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:230835/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:26558/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:28227/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:522528/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:611818/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:63333/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:672439/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1568040/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:750702/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:819376/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:82406/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:840990/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:890275/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:964289/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:987150/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:996376/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1279905/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1079874/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1111006/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:120725/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1258685/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1261655/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1266077/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1279438/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1046000/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1332290/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1335500/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1387422/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1434694/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1498657/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:155270/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGa   >  1:416282/1‑52 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGa   >  1:144745/1‑52 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCACGTGaa  >  1:1228722/1‑53 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCCCAAATGTTTGCCCTTGCCCGt     >  1:1393887/1‑50 (MQ=255) ttAGCAGCTTTGGCTCGACC‑CTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGaa  >  1:1232887/1‑52 (MQ=255) |                                                     TTAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAA  >  W3110S.gb/2267540‑2267592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑