Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2488590	2488780	191	22 [0]	[0] 57	emrK	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component

TCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTATGAA  >  W3110S.gb/2488781‑2488821 |                                         tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:711156/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:427197/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:431462/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:438417/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:44419/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:475418/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:487430/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:533811/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:537653/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:579679/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:616546/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:650805/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:657075/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:665843/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:414687/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:727719/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:729067/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:733125/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:734528/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:760672/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:782049/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:792252/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:806835/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:807371/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:827192/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:847007/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:847222/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:991823/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1585467/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1034001/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1075922/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1135003/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1216443/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1228579/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:12303/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1247193/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1399536/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1416840/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1426214/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1433444/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1445032/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1536824/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1574900/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:103295/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1589952/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1595311/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1644341/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:1648819/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:275050/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:27772/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:30954/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:311652/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:330857/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:331674/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:381058/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtgaa  >  1:385124/1‑41 (MQ=255) tCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTAtga   >  1:537080/1‑40 (MQ=255) |                                         TCCACTATTATCTCTCATTTCTCATAGATGAAATTTATGAA  >  W3110S.gb/2488781‑2488821

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑