Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2527539	2527621	83	42 [0]	[0] 93	xapR	DNA‑binding transcriptional activator

AGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGC  >  W3110S.gb/2527622‑2527683 |                                                              aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCTATACATTATTAGc  <  1:917907/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:417571/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:54342/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:532290/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:526471/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:494358/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:47413/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:472571/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:465106/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:460022/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:452470/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:443351/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:423001/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:578767/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:416536/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:409194/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:408436/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:406551/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:394054/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:390657/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:382391/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:364630/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:347638/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:347213/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:761062/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:936648/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:914493/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:906421/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:871938/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:864221/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:85684/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:847877/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:831457/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:829981/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:814421/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:779878/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:544233/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:746665/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:737512/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:732085/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:694616/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:689386/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:673465/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:672922/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:607141/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:579926/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:292859/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1219063/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1428628/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1364455/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1362911/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1349930/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1314516/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1313556/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1301609/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:128646/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1271277/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1268610/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1225754/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1458836/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1206527/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1199502/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1176352/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1153460/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1146033/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1129495/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1115556/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1112270/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1070418/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1043634/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1634729/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:281227/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:261816/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:23231/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:231873/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:229610/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:220697/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:19950/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:185557/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:181105/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:17484/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:164798/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1038722/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1604168/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1598124/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:158337/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1578561/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1550592/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1510792/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1484837/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1474403/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1469203/62‑1 (MQ=255) aGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGc  <  1:1463985/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGTTCAATCCGCCCTGCTTCTCCCCGACCTATTTGTTCAATCCGAGCCAATACATTATTAGC  >  W3110S.gb/2527622‑2527683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑