Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2531066	2531310	245	108 [0]	[0] 65	yfeN	conserved outer membrane protein

ATCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTC  >  W3110S.gb/2531311‑2531372 |                                                              aTCTACTCCATCAAATTTATCTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGaa     >  1:723337/1‑59 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTg                           >  1:512429/1‑37 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGcc                         >  1:1002526/1‑39 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCGGGCAGTATGAATTc  >  1:1458884/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAAtt   >  1:1471156/1‑61 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAAtt   >  1:1375233/1‑61 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAAt    >  1:897724/1‑60 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:515042/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:611329/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:58696/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:568892/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:566803/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:562294/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:559899/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:344517/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:478665/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:46742/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:414820/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:395203/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:310997/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:620957/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:652591/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:652666/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:680229/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:680300/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:701634/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:719139/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:756996/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:759308/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:792943/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:81383/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:829761/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:890796/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:929273/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1416097/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1058087/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1061353/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:112799/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1136304/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:115529/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1169370/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1195216/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1218591/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1292494/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1296656/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1310940/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1324570/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1342203/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1383289/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:326236/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1527794/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1564479/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1631892/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:1631944/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:166072/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:172786/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:211954/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:264752/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:266395/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:269764/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:272165/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:292015/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:323003/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGACGGGGCTCCCGGCAGTATTAATTc  >  1:1524848/1‑62 (MQ=255) aTCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATAACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTc  >  1:879890/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCTACTCCATCAAATTTAACTTCTGATTGATTACTGCCGGGGCTCCCGGCAGTATGAATTC  >  W3110S.gb/2531311‑2531372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑