Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2540792	2540949	158	232 [0]	[0] 31	ptsI	PEP‑protein phosphotransferase of PTS system

CCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGC  >  W3110S.gb/2540950‑2541011 |                                                              ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTgg   >  1:756050/1‑61 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1462787/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:966159/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:923683/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:877824/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:855691/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:739419/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:687736/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:664393/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:643083/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:537167/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:266280/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:19019/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:164085/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1621346/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1560295/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1022024/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1418593/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1416037/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1355923/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1333338/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1227745/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1227338/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1212252/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1173784/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1163966/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1153649/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:114530/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1046068/1‑62 (MQ=255) ccgtGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1036990/1‑62 (MQ=255) ccgtCCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGc  >  1:1159893/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCGTGCTGAACTTGATCAAGCAAGTTATTGATGCTTCTCATGCTGAAGGCAAATGGACTGGC  >  W3110S.gb/2540950‑2541011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑