Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2541071	2541113	43	16 [0]	[0] 29	ptsI	PEP‑protein phosphotransferase of PTS system

AAGATTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTC  >  W3110S.gb/2541114‑2541174 |                                                             aagtTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1367534/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:260348/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:9745/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:955648/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:947365/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:934658/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:872576/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:632588/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:542355/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:506924/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:486994/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:439960/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:361944/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:345894/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:333698/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:321308/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1028714/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1631530/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1618805/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1560222/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1531525/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1530561/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1394044/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1342596/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:123699/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1187857/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1166308/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1149496/61‑1 (MQ=255) aagaTTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTc  <  1:1113113/61‑1 (MQ=255) |                                                             AAGATTATCCGTAACACGAACTTCGAAGATGCGAAGGTGTTAGCAGAGCAGGCTCTTGCTC  >  W3110S.gb/2541114‑2541174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑