Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2541179	2541371	193	63 [0]	[0] 88	[ptsI]–[crr]	[ptsI],[crr]

CGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATGGTATT  >  W3110S.gb/2541372‑2541432 |                                                             cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTg                            >  1:933633/1‑35 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGa         >  1:1513653/1‑54 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:483509/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:626701/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:616717/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:60293/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:585105/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:567677/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:529316/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:52051/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:501333/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:489872/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:486079/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:684135/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:479419/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:454793/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:446737/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:438967/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:436729/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:421651/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:417179/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:385518/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:35499/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:891628/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:982854/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:972169/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:971314/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:965235/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:935403/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:934785/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:928747/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:918318/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:913860/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:894216/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:328286/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:880137/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:87340/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:842158/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:800845/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:7513/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:728752/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:72764/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:70248/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:690905/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1209518/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1343695/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1001529/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1288701/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1288434/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1283472/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:127634/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1271494/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1264100/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1253636/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1250857/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1324272/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1209175/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1159108/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1132313/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1119573/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1090927/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:107331/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1063672/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1061783/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1053148/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1543141/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:326936/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:308782/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:272341/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:215474/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:19552/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:16479/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1630582/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1605546/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1586957/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1351688/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1526765/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1432274/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1429452/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1389402/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1363867/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1360351/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATg       >  1:1415385/1‑56 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATGGTAta  >  1:1352342/1‑60 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGAGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1313252/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTATGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:469646/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGGCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1235084/1‑57 (MQ=255) cGTCAATATCGAAGACGTGCCGCATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATgg      >  1:1265881/1‑57 (MQ=255) |                                                             CGTCAATATCGAAGACGTGCCGGATGTCGTTTTTGCGGAAAAAATCGTTGGTGATGGTATT  >  W3110S.gb/2541372‑2541432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑