Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2671012	2671012	1	35 [0]	[0] 79	hcaD	phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit

TTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGC  >  W3110S.gb/2671013‑2671074 |                                                              tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:456828/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:570949/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:55345/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:545600/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:545308/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:542759/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:522520/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:509322/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:50766/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:459799/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:581126/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:449710/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:448921/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:441459/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:430267/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:387807/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:371026/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:356178/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:32687/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:310523/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:803460/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:998126/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:991262/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:985821/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:930554/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:917705/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:906242/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:875286/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:834773/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:822005/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:306205/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:784840/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:766059/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:75316/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:73274/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:693931/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:675804/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:662206/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:631279/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1144860/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1000074/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1298805/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1285968/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1259157/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1251663/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:122322/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1208802/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1167519/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1148457/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1329144/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1131710/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1120806/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1112235/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1111920/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:106396/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1014945/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1007176/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1005666/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1004301/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1590615/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:291563/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:257327/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:221622/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:220241/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:172998/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:168910/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1612695/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1596780/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1332431/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1507669/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:149945/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1493576/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1470124/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1451991/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1422136/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1411596/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1385590/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACgc  <  1:1361491/62‑1 (MQ=255) tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACga  <  1:85314/62‑2 (MQ=255) |                                                              TTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGC  >  W3110S.gb/2671013‑2671074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑