Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2736619	2736772	154	37 [0]	[0] 50	pheA	fused chorismate mutase P and prephenate dehydratase

GCCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCA  >  W3110S.gb/2736773‑2736834 |                                                              gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:679820/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1022725/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1574357/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1604199/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1619199/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1640303/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:186180/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:188062/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:19540/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:472523/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:502156/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:557831/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:601975/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1571783/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:685507/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:713346/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:737536/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:819287/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:888110/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:912122/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:939466/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:945868/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:960868/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:978158/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:997910/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1507043/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1032663/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1059658/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1059668/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1129870/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:117478/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1179277/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1224078/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1244122/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1283312/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1291109/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1297403/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1301161/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1323264/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1377236/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1378776/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1390598/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1397506/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1399430/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1428361/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1438054/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1449438/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1490335/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCa  <  1:1546070/62‑1 (MQ=255) gcCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTCTAATCa  <  1:619150/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCCGTCACTTTGAGCAATTCATTGAAAGTGGCTGCGCCAAATTTGCCGATATTTTTAATCA  >  W3110S.gb/2736773‑2736834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑