Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2744874	2744881	8	11 [0]	[1] 97	rpsP/ffh	30S ribosomal subunit protein S16/Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)

GAGGAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGC  >  W3110S.gb/2744880‑2744942   |                                                             gAGGAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAG‑CCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:120279/62‑1 (MQ=255)   ggAACGTAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:261332/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATGTTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1484919/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCTAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1469153/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAGATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1445274/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:483406/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:6074/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:570425/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:558301/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:529906/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:527322/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:525402/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:513276/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:499347/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:490557/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:485735/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:285348/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:476663/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:468217/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:430508/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:407501/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:384341/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:378311/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:375407/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:373959/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:359459/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:333480/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:257232/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:759752/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:99042/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:939962/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:907079/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:89196/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:891210/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:862546/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:860646/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:840588/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:803455/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:7974/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:796187/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:611910/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:740888/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:73566/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:724943/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:723269/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:709821/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:705662/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:686425/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:675497/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:655309/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:639751/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1208949/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:273281/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1403016/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1402697/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1363890/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1350685/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1332448/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1322903/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1301606/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1275069/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1261382/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1230153/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1422814/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1169835/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1160575/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1124084/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1118897/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1097445/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1070990/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1063494/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1020816/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1015293/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1007350/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1603073/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1004622/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:241086/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:235351/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:230114/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:22652/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:203956/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1954/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:187919/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1641890/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1614005/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1434277/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1594767/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1587460/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1579030/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1577042/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1575724/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1552253/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1533163/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1506595/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1493970/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGc  <  1:1492009/61‑1 (MQ=255)   ggAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGAAATTGc  <  1:988015/61‑1 (MQ=255)   |                                                             GAGGAACGGAGTCCGGTGTCATATTAAAAGCCCGAAAATTTTACTCATTTTTGCGGGAATTGC  >  W3110S.gb/2744880‑2744942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑