Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2747873	2747883	11	135 [0]	[0] 66	yfjD	predicted inner membrane protein

TGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAG  >  W3110S.gb/2747884‑2747943 |                                                            tGCTGATGCTCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1606109/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGTGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:319873/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGTGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1642970/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCg                          >  1:1033180/1‑36 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTa                    >  1:868653/1‑42 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGc                  >  1:780979/1‑44 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCaaa   >  1:1019261/1‑59 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCaaa   >  1:29342/1‑59 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCaaa   >  1:729689/1‑59 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:709106/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:517341/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:517409/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:547005/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:549375/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:562332/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:992548/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:583202/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:586792/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1007966/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:587073/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:609320/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:622884/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:707071/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:936879/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:953095/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:728349/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:951202/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:947699/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:770056/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:773627/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:944355/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:822072/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:840895/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:858712/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:937350/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:878573/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1495049/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1032600/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1051008/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1092775/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1117284/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:11197/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1202609/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1227551/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1240178/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1256331/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1324564/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1352385/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:137364/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1398362/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1403065/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:492130/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1510477/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:1623255/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:180040/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:18629/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:223373/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:251545/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:25205/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:295477/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:309369/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:340163/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:372697/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:392689/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:434118/1‑60 (MQ=255) tGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATAGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAaag  >  1:584077/1‑60 (MQ=255) |                                                            TGCTGATGCGCATGATGGGTATCAAAACCGATATCGTGGTTAGCGGCTCTTTGAGCAAAG  >  W3110S.gb/2747884‑2747943

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑