Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2755178	2755324	147	40 [0]	[0] 11	intA	integrase

GTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGA  >  W3110S.gb/2755325‑2755385 |                                                             gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:1152527/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:1209154/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:1354169/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:1413556/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:144311/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:202028/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:206800/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:208659/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:483410/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:745440/1‑61 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtga  >  1:769149/1‑61 (MQ=255) |                                                             GTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGA  >  W3110S.gb/2755325‑2755385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑