Missing coverage evidence...
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AGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACGG  >  W3110S.gb/2769840‑2769901 |                                                              aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:291367/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:901099/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:878742/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:833749/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:792603/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:779353/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:777870/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:710224/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:699988/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:662360/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:520196/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:516012/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:476165/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:471596/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:427801/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:370367/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1028417/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:247482/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:215345/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:195316/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:179121/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1624347/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1613820/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1610822/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1468758/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1438401/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1210999/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1185116/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1164965/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1096009/62‑1 (MQ=255) aGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACgg  <  1:1058725/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGTACAATGTTCGCCAGCTTTACAGCCTCTGCGGTCCCCGGACTCTGGCAACAGGGGTACGG  >  W3110S.gb/2769840‑2769901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑