Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2774714	2774849	136	30 [0]	[0] 99	yfjX	predicted antirestriction protein

CGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCT  >  W3110S.gb/2774850‑2774909 |                                                            cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCTCTGTCTGCCt  <  1:79524/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:452624/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:610732/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:608693/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:573904/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:516630/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:507040/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:499208/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:485336/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:475540/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:475477/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:46688/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:456926/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:617805/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:427851/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:420327/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:405544/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:350621/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:342589/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:330819/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:319435/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:264641/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:258839/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:250773/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:222202/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:824418/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:995019/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:9905/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:986361/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:961668/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:937473/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:919917/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:919504/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:902343/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:887452/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:827257/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:826486/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:612228/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:821286/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:812009/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:792944/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:777245/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:762586/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:758532/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:742487/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:735719/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:679561/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:63801/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:221352/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1253076/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1006377/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1351061/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1345246/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1333181/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:131668/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:130278/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1302310/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1298884/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1295487/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1275662/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:127338/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:125463/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1384598/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1252167/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1235317/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1229204/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1139627/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1121834/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1095232/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1083311/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1075013/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1070553/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1070100/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:105353/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1489297/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:203123/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:202664/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:196054/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:174537/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1641489/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1628531/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1618783/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1581490/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1572575/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1558226/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1511767/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:140950/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1484401/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1476227/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1473844/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:145784/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1456585/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1447121/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1433138/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1424465/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:1423145/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCCGCCt  <  1:1482500/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGAATCGCTGTCTGCCt  <  1:1536191/60‑1 (MQ=255) cGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGAGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCt  <  1:740099/60‑1 (MQ=255) |                                                            CGGCATGAATGGCAATGGTGCGGAAATGAGCGCGGAAGCCGCAGGTATCGCTGTCTGCCT  >  W3110S.gb/2774850‑2774909

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑