Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2795771	2795814	44	35 [0]	[0] 60	yqaE/ygaV	predicted membrane protein/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

TGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAC  >  W3110S.gb/2795815‑2795876 |                                                              tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:730656/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1003864/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:442116/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:482513/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:485773/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:514378/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:54674/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:571811/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:621741/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:623669/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:636141/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:641317/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:664608/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:685168/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:699847/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:423339/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:766961/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:802516/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:850262/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:875275/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:880354/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:881592/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:900490/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:911493/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:9176/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:923602/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:925825/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:95875/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:967811/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:969709/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:403862/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1009705/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1025132/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1025268/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1062851/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1102702/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1124636/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1212813/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1226486/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1233187/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1247962/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1270148/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1300146/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1308878/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1349598/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1438699/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:14411/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1465894/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1477335/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1533767/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:1631800/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:184743/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:23196/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:28200/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:28524/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:294460/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:340278/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:386924/62‑1 (MQ=255) tGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:413372/62‑1 (MQ=255) tGTTGCACTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAc  <  1:753650/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGTTGCATTTTTAGTTTAGAGTTTACTTAATTTAGAAAATACTTAAATAAATATGACTGAAC  >  W3110S.gb/2795815‑2795876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑