Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2816474–2816513 2817028 516–555 13 [0] [1] 81 [argQ]–argY [argQ],argZ,argY

TCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCA  >  W3110S.gb/2817028‑2817090
 |                                                             
tCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGGGTTATTACCGCCa  <  1:308242/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTTGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1496939/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTTCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:964582/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGGCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:936862/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:521784/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:623988/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:623319/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:621386/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:581105/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:574175/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:565226/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:563624/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:540490/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:536832/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:637568/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:510239/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:50975/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:502139/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:49712/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:478902/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:439012/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:412990/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:766667/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:976590/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:963910/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:931370/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:931207/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:930720/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:905770/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:822068/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:803399/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:793202/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:63033/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:751958/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:705404/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:700731/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:700709/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:682069/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:673664/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:672881/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:665011/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:334868/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1248215/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1445660/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1443153/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1410108/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1406092/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1370692/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1305881/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1304055/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1299995/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:126571/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1466604/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1240602/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1233973/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1177475/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1143904/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1128974/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1118895/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1097928/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1048775/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1043954/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1630999/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:101235/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:306566/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:282987/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:239189/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:232398/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:198095/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:188083/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1646343/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:386741/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1622371/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1617130/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1573361/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:154640/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1540693/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1524417/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1494481/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:1466995/62‑1 (MQ=255)
 cGCCCTTCGGGCCGGTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCa  <  1:29682/62‑1 (MQ=255)
 |                                                             
TCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCA  >  W3110S.gb/2817028‑2817090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: