Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2858830	2859090	261	8 [0]	[0] 11	[pphB]	[pphB]

AAGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCATT  >  W3110S.gb/2859091‑2859131 |                                         aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:1060966/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:1105561/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:1231506/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:21582/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:549679/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:558380/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:602046/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:698000/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:853911/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:92897/41‑1 (MQ=255) aaGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCAtt  <  1:943333/41‑1 (MQ=255) |                                         AAGCATGAGTAACCCGGTGTTATTGCAGGCCATTATTCATT  >  W3110S.gb/2859091‑2859131

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑