Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3005396	3005641	246	98 [2]	[0] 44	ygeW	conserved hypothetical protein

ACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAA  >  W3110S.gb/3005642‑3005703 |                                                              aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGgaag             >  1:354567/1‑51 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCgaa  >  1:89875/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:726388/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:347796/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:35898/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:361279/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:37910/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:51742/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:540688/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:601324/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:703781/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:722322/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:329020/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:785543/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:810870/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:853024/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:861207/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:862206/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:862990/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:863359/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:913287/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:963430/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1338402/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1012250/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1017773/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1040872/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1052553/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1111779/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1275807/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1305393/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1310248/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1320797/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1008553/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1345227/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1379803/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1400950/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1456637/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1477299/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1477340/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1521990/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:1575359/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaaa  >  1:298350/1‑62 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaa   >  1:1282551/1‑61 (MQ=255) aCAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCaa   >  1:326721/1‑61 (MQ=255) |                                                              ACAATGCTAAAGCCTCCGGTGGTAGCTTCCGTCAGGTCACCAGCATGGAAGAAGCCTTCAAA  >  W3110S.gb/3005642‑3005703

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑