Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3077886	3077921	36	72 [1]	[0] 44	cmtB	predicted mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS

TGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAG  >  W3110S.gb/3077922‑3077980 |                                                           tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGGTGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1427494/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:493618/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:227330/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:246427/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:304140/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:3089/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:323930/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:375542/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:403294/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:414666/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:429557/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:434019/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:21555/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:555445/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:616175/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:696970/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:700344/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:703503/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:773057/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:860492/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:868645/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:938289/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:976378/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1427204/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1073357/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1109094/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1134661/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1136277/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1141223/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1228454/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1299187/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1331672/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1358225/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1365915/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1007315/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1468605/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1477559/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1484992/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:1506599/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:152215/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:157770/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:16110/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:188836/59‑1 (MQ=255) tGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAg  <  1:189493/59‑1 (MQ=255) |                                                           TGCCAATCTTTTGCTGAATGTATAACTGAGATTGATGATTCTGGAAAATAATCACTAAG  >  W3110S.gb/3077922‑3077980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑