| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 4,290,958 | 0 | G | A | 73.5% | 627.1 / 245.8 | 464 | S2S (AGC→AGT) | acs | bifunctional acetyl‑CoA synthetase and propionyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (123/0); new base A (0/341); total (123/341) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 464 total aligned reads displayed.
CGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAA > W3110S.gb/4290917‑4291005 | cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:249403/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:481315/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:469644/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:136767/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1348370/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1417705/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:170176/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:428813/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1261610/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1254846/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:615226/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1217162/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:231998/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:856050/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:872502/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:604470/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1122469/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1116051/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:273819/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1092831/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:591534/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:947066/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1052189/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:1547805/1‑61 (MQ=255)cGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCt > 1:323005/1‑61 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:537801/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:524918/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:501761/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:682831/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:454247/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:447696/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:438949/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:420113/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:40610/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:384337/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:371096/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:352257/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:776070/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1004862/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:974906/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:954686/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:932218/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:919137/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:891068/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:839629/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:797868/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:783068/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:554500/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:759750/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:742016/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:726301/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:711096/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:693207/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:988074/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:660423/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:647532/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:564370/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1236997/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1429490/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:333581/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:138134/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1375023/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1336903/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1319797/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1303792/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1289149/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1277490/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1398613/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1185196/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:116704/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1162944/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1144137/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1132137/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1105051/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1085995/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1033940/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1017220/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1607527/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:306340/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:285004/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:255396/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:203069/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:197128/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:179122/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1640114/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:161964/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1598586/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1589845/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1571917/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1537627/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1519598/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:149816/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1479014/62‑1 (MQ=255) tgtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1444746/62‑1 (MQ=255) tgtTTGCGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1463937/62‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATTCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:827879/61‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:104816/61‑1 (MQ=255) gtTTGTGAATTTGACTCATACTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:1072740/61‑1 (MQ=255) tttGTGAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:639260/60‑1 (MQ=255) tgtgAATTTGACTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAAGATGTTAATAATATGTGGCATaa < 1:669129/58‑1 (MQ=255) | CGGTCTGCGATGTTGGCAGGAATGGTGTGTTTGTGAATTTGGCTCATGCTTTTGTTCTCCTTGTAGGATGTTAATAATATGTGGCATAA > W3110S.gb/4290917‑4291005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |