Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,039,017 C→A L286I (CTC→ATC)  appC → cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,039,0170CA100.0% 327.4 / NA 114L286I (CTC→ATC) appCcytochrome bd‑II oxidase, subunit I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/114);  total (0/114)

Only 100 of 114 total aligned reads displayed.

CAGGATCAAGAGCGTAACGCCTTTGCCCTCAAAATTCCCGCGCTGCTAGGGATCCTCGCCAC  >  W3110S.gb/1038990‑1039051
                           |                                  
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            cGTAACGCCTTTGCCATCAAAATTCCCGCGCTGCTAGGGATCCTCGCcac  <  1:306674/50‑1 (MQ=255)
                           |                                  
CAGGATCAAGAGCGTAACGCCTTTGCCCTCAAAATTCCCGCGCTGCTAGGGATCCTCGCCAC  >  W3110S.gb/1038990‑1039051

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑