Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 1,078,591 | T→C | K238K (AAA→AAG) | putA ← | fused DNA‑binding transcriptional regulator, proline dehydrogenase, and pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 1,078,591 | 0 | T | C | 100.0% | 285.9 / NA | 99 | K238K (AAA→AAG) | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator, proline dehydrogenase, and pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (99/0); total (99/0) |
ATCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTTTTACCGATAATGCGGTTCA > W3110S.gb/1078550‑1078610 | aTCGCCATATCCCCACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:595341/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTTCCGATAATGCGGTTCa > 1:912447/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCTATAATGCGGTTCa > 1:370071/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGa > 1:1393343/1‑49 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATGATGCGGTTCa > 1:1493449/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTcg > 1:117579/1‑60 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTc > 1:466601/1‑60 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTc > 1:455470/1‑60 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTc > 1:1599249/1‑60 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTc > 1:265049/1‑60 (MQ=255) 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aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:1483318/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:1461242/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:1434913/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:1433992/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:1428385/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:141081/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:141006/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACAGATAATGCGGTTCa > 1:377413/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTAACCGATaa > 1:1063495/1‑52 (MQ=38) aTCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACAGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:986867/1‑61 (MQ=255) aTCGCCATATCCACACCTTAGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:343153/1‑61 (MQ=255) aTCGCCAAATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTCTTACCGATAATGCGGTTCa > 1:32124/1‑61 (MQ=255) | ATCGCCATATCCACACCTTTGCGGATCAGCGGTTCACCGCTTTTACCGATAATGCGGTTCA > W3110S.gb/1078550‑1078610 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |